1、贷款利率不同：组合贷款的贷款利率介于3.25%和4.9%之间；商业贷款无折扣的情况下贷款利率为4.9%。

　　2、贷款的额度不同：组合贷款和商业贷款的贷款额度比公积金的贷款额度高。因此，在公积金贷款额度不够的情况下，可以先选择组合贷款。

　　3、贷款的条件不同：组合贷款必须同时满足公积金贷款和商业贷款的要求。商业贷款的要求是个人信用良好，没有不良征信记录，具备还款能力。只要是购买房屋，不管是普通住宅还是商住楼、别墅、写字楼，都可以采用商业贷款。

　　4、贷款流程的繁简不同：组合贷款中商业贷款部分向贷款银行申请，公积金贷款部分向公积金中心申请，贷款发放的速度比公积金贷款和商业贷款都要慢；商业贷款的流程相对简单，在银行申请商业贷款后，贷款发放周期较短。

　　5、资金来源不同：组合贷款的资金是来自于公积金中心和银行；而商业贷款是以房产作为抵押物，向银行等金融机构获得一次性借款的交易。