1、借款主体不同。政策性住房贷款对借款人是有一定的限制，不是所有人都能够申请到，需有交纳住房公积金的人还有曾经交过住房公积金但现在已经退休的职工才能申请；但商业性住房贷款没那么多限制，只要借款人能有稳定的经济收入都可以进行申请。

　　2、实际贷款的情况不同，政策性住房贷款有额度限制，最高额不得超过30万，贷款期限最长不得超过10年，普遍的利率在于4.59%；而商业性住房贷款额度较宽，一般交纳了3成首付后就可以申请贷款，贷款的期限最高可达30年，利率也高，在5.58%以上。